亲子鉴定原理：孟德尔遗传学。子女的基因型一半来自母亲，另一半来自父回亲。一答般检测出来的DNA数据是以数字的形式体现，表示的是碱基重复数，且每一个基因座位点有两个数字，如果是相同的数字表示纯合子，不同的表示的是杂合子。对比两者的DNA数据，在同一基因位点有完全相同的数字的话表示子代的遗传基因能从亲代中找到来源，符合孟德尔遗传规律。
亲子鉴定否定的：三个以上位点不符合遗传规律的不支持两者存在亲子鉴定关系。即非亲生的。可以对比两者间同一基因座位点的两组数字，完全不相同的基因座位点现象有多个（三个以上）。
亲子鉴定肯定的：所以位点符合遗传规律且累积父权指数大于或等于10000。即亲生的。比对两者间同一基因座位点的两组数字，每一个基因座位点至少有一个数字是完全相同的。
亲子鉴定突变现象：三个或三个以内的位点不符合遗传规律的，被认为是基因突变现象产生的。需要做父母子三联体的亲子鉴定或父子两人同时增加检测到40位点来判定亲子关系。